这是一种非侵入性的评估患儿不良胃肌电活动的有效手段。应用体表胃电及富里叶转换和频谱分析方法可以测定胃窦移动性运动复合波(MMC)。研究表明部分 FD患儿胃窦移动性运动复合波活动明显减少。FD患儿胃动过缓比较多见，而食欲减退的患儿胃窦电活动亢进更多见，说明胃电图检查可以提示胃平滑肌的不良运动(亢进或减慢)，对儿童FD有辅助诊断意义。
胃感觉运动功能障碍是FD的发病机制之一，大部分患儿有胃动力异常。胃动力检测法通过超声了解胃排空情况，观察胃窦收缩频率、幅度，为临床诊断FD提供客观依据，并可在随访过程中对疗效进行评估。此检测方法具有无痛性、无创性、经济、简便、避免射线照射等优点，患儿及家长易于接受。但检查需要患儿配合，<3岁的小儿认知能力不足。较难执行。
水负荷试验协助诊断FD，其特异性高，但敏感性低，且尚未广泛应用于临床。许多FD患儿伴有焦虑、紧张、抑郁等心理因素，通过简单的心理测试，可以了解患儿的心理健康状况，进一步了解患儿病情，从而协助诊断和治疗。
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