木薯淀粉呈白色，淀粉颗粒为圆形或卵形，直径为5-35微米，平均为20微米，颗粒的比重大于水，约为1.6，因而淀粉颗粒在水中容易沉淀。
玉米淀粉是白色微带淡黄色的粉末。普通产品中含有少量脂肪和蛋白质等，吸湿性强，最高能达30%以上。
玉米淀粉用途十分广泛，主要用来制造淀粉糖、有机酸、变性淀粉，还可用于医药、啤酒、造纸、食品加工等行业。
木薯淀粉无异味，适用于需精调气味的产品，例如食品和化妆品等。
木薯淀粉与其他淀粉不同之处在于，其杂质(脂肪、蛋白质和灰分)含量低，直链淀粉含量比其他品种淀粉的低，而且直链淀粉和支链淀粉的分子量都较高。
与玉米淀粉(直链淀粉含量0-70%)和稻谷淀粉(直链淀粉含量0-40%)不同的是，木薯淀粉中直链淀粉含量通常在17%-20%，变化不大。与其他淀粉类似，木薯淀粉的直链分子中并非完全没有支链，但其支链值低于玉米、马铃薯、大米和小麦。
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