有90%的可能是受到细菌的感染，泌尿系统受到感染化脓，使尿液产生难闻的腐臭味，有可能是E-COLI菌，大多发生于恶性肿瘤溃烂、坏死性膀胱炎，如果尿液中有粪臭味，则可能罹患膀胱结肠瘘。
通常尿液放久了，由于细菌分解尿素，自然都会产生阿摩尼亚味，但如果是新排出的尿液就有浓浓的阿摩尼亚味，就要特别注意，很可能是有慢性膀胱炎或尿滞留(指膀胱内的尿液无法排出)。此外，如果长时间憋尿，也可能使尿液中带有阿摩尼亚味。
尿液中含有烂苹果味，就像是苹果摆久了腐烂后带点甜味的味道。这可能是受到一种叫做Ketoacidosis菌的感染，常见于糖尿病酸中毒，是血液中有一种酮的酸性物质会释放出这种味道，由于糖尿病患者的尿液中含有较多的糖分，所以散发出的烂苹果味容易吸引蚂蚁或小虫聚集。
尿中有焦糖味，通常是得了一种槭糖尿病(又叫枫糖尿病，是一种遗传性疾病，患者有先天性代谢功能障碍，无法正常代谢蛋白质，当尿液中排出酸酮，便带着一种类似枫糖浆的味道，这种病也是罕见疾病，平均22.5万人中才会出现一例。
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