功效不同

正露丸的主要功效是化滞止泻，适用于饮食不节或水土不服引起的成人及小儿腹泻，属于湿热、食滞证者。症见：食欲不振，恶心呕吐，腹胀腹泻，消化不良。

而整肠丸适用于邪滞中焦所致的恶心、呕吐、纳差、胃痛、腹痛、胃胀、腹胀、泄泻等症及急性胃炎、急性肠炎见上述证候者。

总的来说正露丸对于湿热食滞症状的患者治疗效果较为明显，而整肠丸对于急性的胃肠道疾病较为明显的治疗效果。

成分不同

正露丸主要是由木油、阿仙粉、黄柏粉、甘草粉、陈皮粉等研制而成，为黑棕色稍软的丸剂,气特异,味有灼舌感。

整肠丸其成分为颠茄提取物、肉桂、丁香、甘草、水杨酸苯酯、薄荷脑等。为棕褐色丸剂，气特异，味辛苦微麻，有清凉感。

产地不同

正露丸是由日本大幸药品株式会社生产的。

整肠丸的得名来之于泰国华侨李万山先生在上个世纪四十年代在中医治疗消化道疾病方面的成就。