羊水穿刺不能查出胎儿是否患有先天性心脏病。
羊水穿刺主要是通过对羊水的分析和培养，对胎儿染色体方面进行检查，它可以筛查出胎儿是否在染色体方面存在畸形和先天性缺陷，也可以查出胎儿是否患有一些遗传性的疾病和基因类的疾病，比如筛查唐氏儿，判断胎儿是否有乙型海洋性血虚和血友病等。但心脏病属于结构性疾病，羊水穿刺是不能检查出来的，可以通过四维彩超排查。
注意：若是由胎儿染色体畸形病变引起的先天性心脏病，羊水穿刺是可以筛查出来的。
羊水穿刺可以查出什么
羊水穿刺是进行染色体、基因病、代谢病的诊断，它可以确诊出先天性呆傻儿、愚型儿等，为后续出生、治疗做准备;还可以诊断出胎儿是否有开放性神经管缺陷，如无脑儿或脊柱裂等;可以具体检查胎儿肺部、肾、肝、皮肤的成熟度，预测胎儿血型，诊断是否会发生新生儿溶血;羊水穿刺还可以检测出宫内是否感染，如羊水中白细胞介素-6升高，则可能存在亚临床的宫内感染。
其次，羊水穿刺还可以检查唐氏儿，所以，唐氏筛查的结果为高危的孕妇应再做一次羊水穿刺。
另外，通过分析羊水也可以判断出一些与基因有关的疾病，如乙型海洋性血虚和血友病等。还能根据羊水来了解胎儿的成长的具体情况，并明确预产期。
最后，羊水穿刺可以根据染色体的排列检查出胎儿的性别。
孕期可以检查出胎儿是否有先天性心脏病吗
怀孕24-28周时，孕妇可以通过四维彩超筛查胎儿是否有先天性心脏病。
四维彩超是用于观察宫内胎儿的生长发育情况，筛查胎儿畸形，为早期诊断胎儿先天性体表畸形和先天性心脏疾病提供准确的科学依据。
注意：先天性心脏病有很多种类型，有的比较严重的，能通过B超监测出来;但有些轻微的，在胎儿期间是无法看出来的，例如：室间隔缺损，动脉导管未闭这两种情况，在胎儿期间，囊卵孔就是处于开放的状态，天然开放，是自然状态，所以不能在胎儿时期去判断，除非胎儿的“房缺”十分大，比正常卵圆孔大很多，才有可能去判断。
孕期如何预防替胎儿先天性心脏病
1、做好孕期保健
孕期病毒感染，服用不当的药物，或是受过什么惊吓、生活不安定、休息不佳等因素都可能导致胎儿出现先天性心脏病所以，为了预防先天性心脏病的发生，妊娠期一定要做好保健，特别是在妊娠早期保健，要积极预防风疹、流行性感冒、腮腺炎等病毒感染。避免接触放射线及一些有害物质。
在医生指导下用药，避免服用对胎儿发育有影响的药物，如抗癌药、甲糖宁等。积极治疗原发病，如糖尿病等。注意膳食合理，避免营养缺乏。防止胎儿周围局部的机械性压迫。总之,为预防先天性心脏病, 就应避免与发病有关的一切因素。
2、避免强磁场
在怀孕早期(3个月前)尽量别在计算机前微波炉等磁场强的地方坐太长时间因这时的胎儿还不稳定各个器官还正在成形阶段很可能造成孩子先天性心脏病。
3、避免接触宠物
不要接触宠物因宠物身上的细菌及微生物也可能造成孩子先天性心脏病。
4、婚检
先天性心脏病很大一部分是由遗传引起的，它在儿童中的发病率大约为4‰～8‰。所以，要想预防先天性心脏病，婚前去医院进行婚前检查及遗传咨询很重要。特别是曾患有先天性心脏病的父母，在怀孕前最好到心脏病专科去做检查，听医生的建议，进行遗传咨询，再确定是否要生育。
