新生儿肺炎根据病因不同可分为：新生儿吸入性肺炎和新生儿感染性肺炎。前者又可分为羊水吸入肺炎、胎粪吸入性肺炎、乳汁吸入性肺炎。
1.新生儿吸入性肺炎新生儿由于吸入羊水、胎粪或乳汁后引起肺部化学性炎症反应/继发感染统称新生儿吸入肺炎。临床除有气道阻塞、呼吸困难为主要临床表现的综合征外，胸片表现为持续时间较长的肺部炎症改变。吸入物的性质、量以及吸入深度不同，临床表现也各异。
（1）羊水吸入肺炎 指胎儿在宫内或分娩过程中吸入较大量羊水。一般指羊水未被污染，临床轻重与羊水吸入量多少有关。
（2）胎粪吸入性肺炎 是宫内或产时吸入较多混有胎粪的羊水，是产前或产时发生的最常见的吸入性肺炎。以呼吸窘迫为主要临床表现的综合征。病理改变为呼吸道的机械性阻塞和化学性炎症。多见于足月儿或过期产儿。
（3）乳汁吸入性肺炎 指乳汁在吞咽时被吸入呼吸道，引起窒息、呼吸困难等表现，肺部继发感染时与细菌性肺炎相似。严重程度与吸入的量和次数有关。新生儿由于吸入羊水、胎粪或乳汁后引起肺部化学性炎症反应/继发感染统称新生儿吸入肺炎。对乳汁吸入性肺炎的患儿要注意：早产儿奶量增加不易过快；疑食管闭锁等畸形而尚未确诊前喂养有发生吸入的危险，故首次喂养常推荐用水或葡萄糖水；抬高床头和喂养后侧卧可减少吸入的危险。
肺炎时，由于气体交换面积减少，和病原体的作用，可发生不同程度的缺氧和感染中毒症状，如低体温，反应差，昏迷，抽搐以及呼吸、循环衰竭。可由毒素、炎症细胞因子、缺氧及代谢紊乱、免疫功能失调引起。
缺氧的发生可由于下列因素引起：小气道因炎症、水肿而增厚，管腔变小甚至堵塞。如小支气管完全堵塞，则可引起肺不张。病原菌侵入肺泡后损伤肺泡，促发炎症介质与抗炎因子的产生，加重组织破坏，使促纤维因子增加，使肺纤维化。炎症使PS（磷脂酰丝氨酸）生成减少、灭活增加，可致微型肺不张，使肺泡通气下降。
肺透明膜形成、肺泡壁炎症、细胞浸润及水肿，致肺泡膜增厚，引起换气性呼吸功能不全。当细胞缺氧时，组织对氧的摄取和利用不全，加上新生儿胎儿血红蛋白高，2，3-DPG（2，3-二磷酸甘油酸）低，易造成组织缺氧，以及酸碱平衡失调，胞浆内酶系统受到损害，不能维持正常功能，可引起多脏器炎性反应及功能障碍，导致多器官功能衰竭。
