呼吸抑制

丙泊酚临床运用过程中极易导致患者发生呼吸抑制，即使诱导剂量的丙泊酚也可引起患者呼吸频率减慢和潮气量降低，甚至可引起呼吸暂停，其程度和发生频率大于同类的其他静脉麻醉药。

丙泊酚输注综合征(PRIS)

PRIS为丙泊酚运用过程中最大的风险，一旦发生PRIS，其治疗成功率低，故在临床上以预防为主。

目前认为，输注速率超过5 mg/kg /h 的长时间丙泊酚输注可能导致丙泊酚输注综合征。

惊厥样反应

丙泊酚既有抗惊厥作用，又有神经兴奋性，但其神经兴奋性少见，多发生在麻醉恢复过程中，通常为一过性。

潜在的成瘾及滥用

通过激活γ氨基丁酸受体A(GABAA)，丙泊酚可以使机体产生生理和精神上的欣快感，故存在潜在的成瘾及滥用问题。