射精障碍也是导致男性不孕不育的主要原因之一，比如阳萎、外生殖器畸形、外伤等，这些原因导致男性不能进行性生活，或早泄、逆行射精等，精液不能进入女性生殖道内，也不能孕育成胎。这种原因导致的不育症只要是积极的治疗是可以获得好转的。
免疫性不育也是导致男性不孕的主要原因之一，生殖免疫系统研究证实，血液与睾丸之间存在血睾屏障。血睾屏障一旦遭到生物、化学、物理因素的破坏后，精子抗原就会漏出，单核吞噬细胞进入睾丸或附睾，吞噬精子、对精子抗原进行消化处理，使睾丸、附睾、输精管等组织遭到破坏，引起自身免疫性睾丸炎，导致不育。
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