原料不同

医用酒精的成份主要是乙醇。医用酒精是用淀粉类植物经糖化再发酵经蒸馏制成，相当于制酒的过程，但蒸馏温度比酒低，蒸馏次数比酒多，酒精度高，制成品出量高，含酒精以外的醚、醛成分比酒多，不能饮用，但可接触人体医用。是植物原料产品。

而医用酒精一般是无毒的，不过医用酒精由于有很强的刺激性，如果一不小心弄到眼睛里面以后，就会表现为结膜充血以及角膜上皮脱落等，建议使用医用酒精的时候一定要注意。

气味不同

工业酒精中由于含有甲醛所以一般都有刺激性的气味，而医用酒精就只有单纯的乙醇味，无其它异味。