初为稀便，4～6次/日，进行性加重排黏液血便和脓液。急性发病者开始即为血便伴腹痛、呕吐、发热及其他中毒症状。
轻者常不明显，重者可有发热，水电解质紊乱；患儿由于长期腹泻、便血、食欲不振、心率增快、衰弱、精神萎靡，久之即出现贫血和营养不良等表现，约有3%的患儿表现为情绪不稳定，如抑郁、焦虑、失眠等；重症病例亦可伴有生长发育障碍，青春发育延迟，部分患儿伴有精神、心理及情绪异常。
25%的患儿可伴有关节炎，以四肢和脊柱为主，关节症状有时发生在腹泻之前。10%的患儿发生皮肤病变，如结节性红斑、坏疽性脓皮病。2%可伴有视网膜炎、口腔溃疡等。
起病多数缓慢，病程可为持续性，常有发作期与缓解期交替，10%的患儿为急性发作，病情发展快，全身中毒症状明显，并发症多见，病死率高，缓解期病情亦可突然加剧，精神刺激、疲劳、肠道炎症、饮食失调常为本病的诱发因素。
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