少数胆道蛔虫病患者可因蛔虫进入肝脏带入细菌，继发感染形成细菌性肝脓肿。脓肿以肝右叶最常见，左叶较少，可为单发或多发性，其大小不一。脓液中可找到蛔虫和虫卵；脓肿壁上可查虫卵和虫体所引起的异物反应。蛔虫性肝脓肿与一般肝脓肿表现相似。但合并症较多，临床经过极为严重。容易引起肝功能损害，甚至出现急性肝功能衰竭。还可出现胆管炎、胆道出血、脓毒败血症、脓胸、膈下脓肿等，病死率可达80%左右。
蛔虫卵性肉芽肿多位于腹腔脏器的表面，表现为发热、腹部隐痛、腹部包块。临床较少见，因无特征性表现，诊断较困难。文献报道的病例均为手术活检确诊。本病容易误诊为肠系膜淋巴结炎、肠结核、结核性腹膜炎及腹腔肿瘤等。
蛔虫可经小肠或阑尾等腹腔脏器穿孔进入腹膜腔，由于肠内容物流入腹腔引起化学性刺激和细菌感染，导致腹膜炎。有报道肠蛔虫病所致外科合并症中腹膜炎占 12.75%。其表现与其他原因所致的化脓性腹膜炎相同，主要为持续性剧烈腹痛、腹胀，发热，呼吸急促，脉搏加快，腹部压痛、反跳痛，肝浊音界缩小或消失等。
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